1. Zajęcia w Akademii Ninja nie są obowiązkowe.
2. Ukończenie Akademii jest wymagane do otrzymania rangi Genin.
3. Akademia Ninja jest bezpłatna.
4. Aby podjąć naukę w Akademii należy złożyć wniosek w wątku Zapisy.
5. Do klasy można dopisać się w każdej chwili, do momentu przeprowadzania zajęć praktycznych. W tym wypadku Student musi zapoznać się z przerobionym materiałem.
6. Student nie musi być obecny na zajęciach teoretycznych Akademii. Musi jednak wziąć udział w zajęciach praktycznych.
7. Po przerobieniu tematów z Programu Nauczania nauczyciel organizuje egzamin końcowy.
8. Egzamin końcowy składa się z dwóch części
a. teoretycznej (pytanie kontrolne i sprawdzenie poprawności wykonania jednej z technik podstawowych; egzaminuje nauczyciel)
b. praktycznej (zademonstrowanie swoich umiejętności Jounin-Sensei; egzaminuje Jounin-Sensei).
9. Po zdaniu części teoretycznej Student otrzymuje Opaskę ninja i zostaje przydzielony do trzyosobowej grupy Geninów, nad którymi opiekę sprawuje Jounin-Sensei.
10. W przypadku oblania egzaminu praktycznego uczeń może raz spróbować go poprawić. Potem wraca do Akademii i czeka na kolejną szansę. Zostaje wtedy automatycznie przypisany do nowej klasy. Jest zwolniony ze wszystkich zajęć. Przystępuje tylko do egzaminu końcowego.
11. Aby powstałą klasa musi być przynajmniej 3 zadeklarowanych Studentów.